Los apuntes se diferencian de los materiales autosuficientes en que son estáticos, pueden tener actividades pero son de realización no interactiva (los tradicionales enunciados de ejercicios)
Intentaré comenzar colocando informaciónaquí, pero luego separando en páginas aparte según su volumen y contenido: por ejemplo apuntes por curso (3º ESO, 4º ESO, Física y Química 1º Bachillerato, 2º Bachillerato (2º Bachillerato Física, 2º Bachillerato Química),...), por contenido (apuntes física, apuntes química, apuntes formulación,...)

Apuntes de elaboración propia

Además de enlaces a apuntes en la web, en esta página coloco recursos y apuntes de elaboración propia con licenciamiento cc-by.

Apuntes generales, física y química

• FisQuiWeb, Espacio Web dedicado a la enseñanza de Física y Química
  http://web.educastur.princast.es/proyectos/fisquiweb/Apuntes/apuntes.htm
  Materiales bajo licencia Creative Commons (cc-by-nc-sa). Incluye apuntes de varios cursos (3º y 4º ESO, 1º Bachillerato, Física 2º Bachillerato y CMC 1º Bachillerato)
• CIDEAD, Enseñanza a distancia
  http://recursostic.educacion.es/secundaria/edad/index_fq.htm
  cc-by-nc-sa
  
• Apuntes de bachillerato y selectividad.
  http://www.selectividadonline.com/apuntes-y-trabajos/
  Distintos autores que ofrecen apuntes con licenciamiento cc.
• http://www.selectividadonline.com/apuntes/fisica Elaborados por Roberto Santamaría e informatizados por Eduardo Montoya. cc-by-nc-sa
• http://www.selectividadonline.com/apuntes/quimica Elaborados por Alfonso Pérez e informatizados por Eduardo Montoya Marín. cc-by-nc-sa
• Heurema, APUNTES DE FÍSICA Y QUÍMICA EN BACHILLERATO
  http://www.heurema.com/ApFQBachillG.htm
  Apuntes en pdf con ejercicios. Jaime Solá de los Santos, José Luis Hernández Pérez y Ricardo Fernández Cruz. Licenciamiento no detallado.
  
• "Física en Wikillerato-Educared.org Fundación Telefónica"
  http://www.educared.org/wikiEducared/index.php/Fisica
  http://www.educared.org/wikiEducared/index.php/Quimica
  Juan Ignacio Valero. Licenciamiento Creative Commons cc-by. (algunos enlaces son externos a recursos con otros licenciamientos)
  Apuntes en las páginas html. La estructura contempla tests, dudas, ejercicios, pero no suelen tener contenido
• Plataforma e-ducativa aragonesa. Apuntes y materiales de 80 asignaturas, incluyendo física, química, CMC, ... y por nivel.
  http://e-ducativa.catedu.es/44700165/sitio/index.cgi?wid_item=118&wid_seccion=22
  Licenciamiento no detallado
  
• Departamento Física y Química IES Sierra de San Quilez, Binéfar
  http://iesbinef.educa.aragon.es/fiqui/ ó http://centros4.pntic.mec.es/~sierra8/
  Apuntes por cada curso. Licenciamiento no indicado. Incluye exámenes selectividad.
  Nota: en febrero 2012 fallan algunos enlaces entrando por la dirección de aragon.es pero no en la de mec.es.
• Apuntes de física (con algunos contenidos de química y formulación)
  http://www.gobiernodecanarias.org/educacion/3/Usrn/fisica/
  "Páginas elaboradas por J. Trujillo (I.B. Joaquín Artiles) con la finalidad de facilitar el estudio de la Física a los estudiantes de Bachillerato, encontrarás también enlaces, dentro de los temas, a otras páginas que te ayudarán a visualizar mejor lo que se esté tratando en el momento..."
  
• "Mirar al Cielo" Apuntes Física 2ºBachillerato y Ámbito Científico Tecnológico
  http://www.miraralcielo.com/apuntes/index_apuntes.htm
  http://www.miraralcielo.com/malet%C3%ADn%20web/apuntes_amb_cient/indexapuntes_ambito_ci.htm
  Copyright © Matías Vázquez  Dereitos Reservados  ISBN: 978-84-690-9821-9 
• fisicayquimicaenflash.es
  Apuntes 1º y 2º Bachillerato física http://fisicayquimicaenflash.es/fisicateoria.htm
  Apuntes 1º y 2º Bachillerato química http://fisicayquimicaenflash.es/quimicateoria.htm
  Apuntes 3º y 4º ESO física y química http://fisicayquimicaenflash.es/eso/eso.html
  Ramón Flores Martínez Prof. de Física y Química IES Sánchez Lastra (Mieres - Asturias). Licenciamiento cc-by-nc-nd
• Naturaleza educativa. Portal educativo de ciencias naturales y aplicadas.
  http://www.natureduca.com/fis_indice.php
  http://www.natureduca.com/quim_indice.php
  Apuntes por bloques, mucho más que física y química. Asociación Española para la Cultura, el Arte y la Educación (ASOCAE O.N.G.D.) - ww.asocae.org - RNA 592727 - CIF.: G70195805 ¦ © Obra bajo licencia Creative Commons cc-by-nc-nd
• Fisilanda
  http://www.fisilandia.es/index.php/apuntes
  ESO y 2º Bachillerato. Gabriel Villalobos con licenciamiento cc-by-nc-nd
• Apuntes, escritos y ensayos científicos
  http://www.escritoscientificos.es/apunquim/inicio.htm
  Felipe Moreno Romero. Licenciamiento cc-by-nc-sa 
• Recursos, apuntes Departamento de Física y Química IES Reyes Católicos
  http://www.iesreyescatolicos.es/portada/index.php?option=com_content&view=article&id=79&Itemid=149
  Apuntes en pdf por curso y bloques. Licenciamiento no detallado pero página web indica © 2012 IES Reyes Católicos
• Wikispaces Colegio El Limonar (Málaga) con apuntes bachillerato
  https://limonar.wikispaces.com/1%C2%BABACHILLERATO_FyQ
  https://limonar.wikispaces.com/2%C2%BA+BACHILLERATO_F%C3%8DSICA
  https://limonar.wikispaces.com/2%C2%BA+BACHILLERATO_QU%C3%8DMICA
  Contributions to https://limonar.wikispaces.com/ are licensed under a GNU Free Documentation License.
• http://www.educa.madrid.org/web/ies.victoriakent.torrejondeardoz/Departamentos/DFyQ/Materiales/Bach-2/bach-2.htm
  Sin licenciamiento detallado.
• escire.
  http://www.escire.com/fisica-y-quimica/
  Apuntes por curso y bloques. Ejercicios y laboratorio.Licenciamiento no detallado. Aurora Lucas.
• IES Al-Ándalus. Departamento física y química.
  http://www.iesalandalus.com/joomla3/index.php?option=com_content&task=view&id=24&Itemid=40
  Temas, ejercicios y exámenes. Licenciamiento no detallado.
• Departamento de Física y Química IES Ntra. Sra. de la Almudena - Madrid
  http://almudenafyq.webcindario.com/index.html
• Física y química.
  https://sites.google.com/site/javirobledanofq/Home
  Recursos y materiales de aula, por curso y bloque. Javier Robledano Arillo. Licenciamiento cc-by-nc-nd
• Materiales didácticos para descargar libremente - Formato (.pdf)
  http://vviana.es/materiales.html
  Vicente Viviana Martínez.
• Materiales digitales de estudio y aprendizaje para bachillerato y preparación para la universidad.
  http://www.profesorjano.info/p/pagina-de-fisica.html
  http://www.profesorjano.info/p/pagina-de-quimica.html
  Esta página contiene los materiales que se van publicando sobre la asignatura de QUÍMICA  de 2º de bachillerato.
  Licenciamiento no detallado. http://about.me/profesorjano Blog académico de PROFESOR JANO en donde se publican los materiales que imparto ya sea en el colegio, en clases particulares o en educación a distancia.
• http://quimife.wordpress.com/2010/04/12/repaso-del-curso-fisica-y-quimica-1%C2%BA-bachillerato/ (Física y Química 1º Bachillerato)
  http://quimife.wordpress.com/2010/04/09/repaso-del-curso/ (Química 2º Bachillerato)
  Licenciamiento no detallado
• http://www.100ciaquimica.net/asigfq/index.htm
  Material con Copyright
• PÁGINA WEB PERSONAL DE CONTENIDOS DE FÍSICA Y QUÍMICA
  http://www.telefonica.net/web2/fisicayquimica/
  IES ALMICERÁN Departamento de Física y Química. Copyright Francisco José Moreno Hueso
• Departamento de Física y Química IES Nicolás Copérnico. Écija. Sevilla
  http://www.iesnicolascopernico.org/LAMP/
  Apuntes y ejercicios por curso de ESO y de Bachillerato.
• Departamento Física y Química IES Carmen Martín Gaite
  http://ies.carmenmartingai.moralzarzal.educa.madrid.org/departamentos/quimica/materiales.html
  Apuntes y ejercicios por niveles desde 3º ESO hasta 2º Bachillerato
• Página personal Oscar Carpintero Física y Química
  http://www.mipaginapersonal.movistar.es/web3/oscar
  Apuntes por niveles
• Apuntes y ejercicios física y química por niveles
  http://www.iesanamariamatute.com/departamentos/dpto_fisica_quimica/fisica_apuntes_ejercicios.asp
• Blog de Física y Química. IES Juan de la Cierva
  http://aula44.wordpress.com/
  Apuntes por niveles desde 2º ESO hasta 2º Bachillerato.
• Departamento de Física y Química IES "Rey Fernando VI" @ Jesús Millán Crespo
  http://chopo.pntic.mec.es/jmillan/
  Apuntes por niveles, con ejercicios.
• Departamento de Física y Química del IES Leopoldo Queipo de Melilla.
  https://sites.google.com/site/depfqlqueipo/apuntes
  Apuntes y ejercicios por curso.
• http://www.matematicasfisicaquimica.com/
  Recursos de Matemáticas, Física y Química por temas. Copyright
• http://ciencias.com.es/index.php/descargas
  Apuntes de 1º a 4º ESO en español y bilingües
  Jaime Ruiz-Mateos
• https://sites.google.com/site/depfqlqueipo/apuntes
  Apuntes y ejercicios desde 3º ESO a 2º Bachillerato
  Verónica Fernández Martos, . Salvador Molina Burgos, Miguel Sánchez Cazorla, Departamento de Física y Química del IES Leopoldo Queipo de Melilla.
• http://fqsecundaria.blogspot.com.es/search/label/Apuntes
  Diego Palacios, curso 2015-2016 de 4º ESO, 1º Bach LOMCE y 2ºBach
  

Apuntes Física

• Física Fácil
  http://www.fisica-facil.com/Indicetematico/marcos.htm
  Teoría, ejercicios y problemas. Profesores CASATROJA - FERREIRA, MONTEVIDEO - URUGUAY. Derechos reservados.
• wiki del Departamento de Física Aplicada III en la Escuela Técnica Superior de Ingeniería de la Universidad de Sevilla.
  http://laplace.us.es/wiki y http://tesla.us.es/wiki (dos servidores para evitar congestión)
  El objeto de estas páginas es servir como almacén de apuntes y otros contenidos de las asignaturas impartidas por este Departamento. Este material es elaborado por los profesores del Departamento y no puede ser editado libremente. Licenciamiento cc-by-nc-sa.
  Aunque sea material de una universidad tiene material utilizable en  bachillerato
  
• Hiru.com
  http://www.hiru.com/fisica/
  Estática y dinámica, Calor y Temperatura, Gravedad, órbitas y rotación, Carga eléctrica y circuitos, Movimiento armónico y ondas, Física nuclear. cc-by-nc-sa Gobierno vasco.
• http://www.cajondeciencias.com/fisica.html
  Recursos física secundaria por temas
• http://es.slideshare.net/ymilacha Física para medicina, Apuntes por bloques, Yuri Milachay
  
  

Apuntes Física 2º Bachillerato

• Ver en Recursos física 2º Bachillerato
  

Apuntes Química

• "Full Química. Recursos para profesores gratis"
  http://www.fullquimica.com/
  César De Paz, Lima - Perú. Copyright
  
• An Introduction to Chemistry  by Mark Bishop.  Atoms-First Version y Chemistry-First Version
  http://preparatorychemistry.com/Bishop_Atoms_First.htm
  http://preparatorychemistry.com/Bishop_Chemistry_First.htm
  Both versions are available as regular printed books, but they are also available on the Internet with no usernames and no passwords.
  
• Apuntes - Teoría Química Orgánica
  http://organica1.org/teoria.html
  Dr. Carlos Rius Alonso, Universidad Nacional Autónoma de México
• Chalkbored Chemistry Lessons
  http://www.chalkbored.com/lessons/chemistry-11.htm
  http://www.chalkbored.com/lessons/chemistry-12.htm
  On this page you will find resources for high school chemistry: worksheets, labs, handouts, and PowerPoint lessons. All materials posted here are intended for educational nonprofit use. Feel free to use them in your classroom or for your personal use. However, they are not to be shared, sold, or distributed in any manner without permission.
• Antología de la química II
  http://www.slideshare.net/tango67/antologa-de-quica-ii
• http://www.uclm.es/profesorado/pablofernandez/QG-08-equilibrio%20redox/redoxteoria.pdf
• http://www.cajondeciencias.com/quimica.html
  Recursos química secundaria por temas
• Materiales escritos / resúmenes química de Ernesto de Jesús Alcañiz, Universidad de Alcalá de Henares
  http://www2.uah.es/edejesus/resumenes/inicio.htm
  Copyright http://www2.uah.es/edejesus/copyright.htm
  

Apuntes Química 2º Bachillerato

• Ver en Recursos química 2º Bachillerato
  

Apuntes formulación

Creada página aparte